(1)針對不同地區(qū)(如不同氣候帶等)的修復(fù)對象，結(jié)合客觀實際,優(yōu)先選用土著種、化感作用強(qiáng)、根際固定作用強(qiáng)的沉水植物用于控制藻類及沉積物內(nèi)源污染；

(2)在沉水植物群落構(gòu)建初期，采取相應(yīng)措施減少相關(guān)因素對沉水植物生長的影響，如通過添加絮凝劑等透明度提升工程、浮游動物控藻手段等，保證沉水植物在修復(fù)初期快速生長；

(3)為促進(jìn)沉水植物群落結(jié)構(gòu)的快速形成，建議在初期去除水體中草食性魚類和底層魚類，以減少魚類對沉水植物的攝食及對沉積物的擾動；

(4)當(dāng)系統(tǒng)趨于穩(wěn)定時，適當(dāng)放養(yǎng)肉食性魚類(如鱖魚等),結(jié)合生物操縱原理，進(jìn)行水生態(tài)系統(tǒng)構(gòu)建，使生態(tài)系統(tǒng)中的上行效應(yīng)和下行效應(yīng)得以發(fā)揮，從而進(jìn)一步加強(qiáng)系統(tǒng)的穩(wěn)定性。

通過對梁子湖與湖北省其他四個不同水深的湖泊間菹草石芽萌發(fā)率月動態(tài)的野外調(diào)查和萌發(fā)實驗，發(fā)現(xiàn)無光環(huán)境下菹草石芽的萌發(fā)率較有光下的小;五個湖泊的石芽均于7月初即開始萌發(fā)，相同月份不同湖泊石芽的平均萌發(fā)率基本與其平均水深成負(fù)相關(guān)關(guān)系，但12月初各湖泊的平均萌發(fā)率相近(>95%);同一湖泊水深越大，相同月份的萌發(fā)率越低，水深的增加能顯著推遲萌發(fā)起始時間，但不改變其終萌發(fā)率(12月初>95%)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)在光照和缺乏基質(zhì)的條件下，菹草石芽的萌發(fā)率和出苗率提高，光對菹草萌發(fā)苗根的生長無促進(jìn)作用。

當(dāng)湖泊水體中氮磷營養(yǎng)物質(zhì)過剩時，水體中浮游藻類會暴發(fā)性生長，覆蓋水體表層，導(dǎo)致水體透明度降低，太陽光照無法到達(dá)沉水植物表面或光照不足以維持沉水植物的光合作用過程，從而導(dǎo)致沉水植物的退甚至逐漸消亡，沉水植物的缺失會加劇湖泊水質(zhì)的惡化，使湖泊生態(tài)系統(tǒng)由清水穩(wěn)態(tài)向濁水穩(wěn)態(tài)轉(zhuǎn)化。

水下光場分布

富營養(yǎng)化導(dǎo)致的水質(zhì)惡化，會對水體水下光場分布產(chǎn)生直接的影響。在透明度較高的長江中下游湖泊中，水下光照度大值出現(xiàn)在560nm左右，隨著水深的增加，光照會逐漸衰減，但是衰減速率相對較慢

任何一個生態(tài)因子如溫度、光照，在數(shù)量或質(zhì)量上不足或過多，即接近或達(dá)到某種生物的耐受性限度時會使該生物退或不能生存。全國有分布的沉水植物即表現(xiàn)為較寬的生態(tài)幅（廣鹽性、廣溫性、廣光性等），比如穗狀狐尾藻（Myriophyllum spicatum L.）既可生長在淡水中，也可生長在鹽度小于10‰的咸水中。這些植物但盡管能適應(yīng)較寬生態(tài)幅，卻能主動從形態(tài)、生理、行為等方面對自身進(jìn)行調(diào)整。比如輪葉黑藻（Hydrilla verticillata），每年進(jìn)入11月份，長江中下游及以北地區(qū)慢慢凋亡，從新芽停止生長到老葉脫落到根莖的腐爛，周期持續(xù)約1個月，當(dāng)然也有少量可以保持很綠沒有腐爛的情況。