Tris通常被用于核酸DNA或RNA的瓊脂糖凝膠電泳中的緩沖液，通常用的緩沖體系有TAE、TBE、TPE等，即生物緩沖劑Tris配合EDTA以及醋酸、硼酸、磷酸等配制成的緩沖溶液。不同公司使用的緩沖液有所差異，相對來說使用磷酸的TPE較少，主要是使用TAE和TBE緩沖液。在做核酸瓊脂糖凝膠電泳時，首先的準備工作就是制備凝膠，瓊脂糖凝膠做的好壞直接影響電泳效果和效率。這個制作過程耗時較長，節(jié)約時間考慮也可以直接購買制備好的預制凝膠。

提到緩沖液就不得不延伸一下，這就是Henderson-Hasselbalch方程。

在前面提到，

將等式同時取對數(shù)，并簡化就可以得到：

或者

這就是Henderson-Hasselbalch方程。

注意：式子中酸及其共軛堿的濃度都是平衡時的濃度，除了酸性過于強的情況下，由于同離子效應的存在，一般都可用此式計算。

 此外，一些緩沖體系對溫度非常敏感，例如Tris-HCl緩沖液，如果你在25℃時將緩沖體系調至pH值8，pH值將在5℃時增加到8.58而在37℃時降到7.71。所以，如果打算在4℃條件下保存蛋白或在37℃進行實驗，就應該考慮到室溫下調的pH值可能在實驗條件中就不適用了。  其他類型的色譜分離柱，如凝膠過濾柱和Ni2 親和層析柱，可能需要更高的鹽濃度。我一般用高達500 mM NaCl進行高鹽淋洗，以防止蛋白和柱之間的非特異性結合。