提取糞便微生物基因組進行測序，分析不同處理糞便菌群的豐度和多樣性，從宏觀上評估發(fā)酵飼料對豬腸道微生物菌群的影響。從表6可以看出，發(fā)酵組豬只糞便菌群物種的豐度指數(shù)Sobs顯著高于對照組和組（P＜0.05），對照組和組相比差異不顯著；發(fā)酵組和組的Chao1指數(shù)和Ace指數(shù)顯著高于對照組（P＜0.05）。與對照組和組相比，發(fā)酵組的多樣性指數(shù)Shannon升高、 Simpson指數(shù)降低，但均未達到顯著水平。表明飼喂發(fā)酵飼料可以提高豬糞便菌群的豐度，同時具有提高糞便菌群多樣性的趨勢

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盡管單獨加入酶或菌時都可以降解并轉化秸稈中的纖維素成分，從而提高秸稈的利用價值，但都存在或多或少的不足，如果利用酶和菌之間的互相作用協(xié)同處理秸稈則能夠取得更佳的效果。陳合等（2008）采用黃孢原毛平革菌結合外源纖維素酶和木聚糖酶共同降解玉米秸稈，顯著提高了其還原糖含量。李新社等（2011） 已利用纖維素酶和康寧木霉菌共處理玉米秸稈將其轉化為可發(fā)酵糖，并從玉米秸稈降解物中獲得了4.852g/L 的還原糖。菌酶共降解工藝為利用秸稈提供了一種新的研究方法，現(xiàn)已立足于玉米秸稈的生物發(fā)酵領域并成為其中的一個研究熱點。

玉米秸稈青貯與玉米秸稈顆粒喂牛羊只能說各有各的好處，不能全部歸于一方，桔桿的營養(yǎng)很少，青貯是保存了枯桿的部份維生素營養(yǎng)，并經(jīng)過發(fā)酵后，乳酸含量多，對牛羊反芻動物來說，青貯更適合胃內(nèi)消化。用青貯方法秋收后上保持青綠或部分青綠的玉米秸稈較長期保存下來，可以很好的保存其養(yǎng)分，而且質(zhì)地變軟，具有香味，能增進牛、羊食欲，解決冬春季節(jié)飼草的不足。通知制作青貯飼料比堆垛同量干草要節(jié)省一半占地面積，還有利于防火、防雨、防腐爛及消滅秸稈上的農(nóng)作物害蟲等。