水污染源包括工業(yè)廢水、生活污水、醫(yī)院污水等。在制訂監(jiān)測方案時，首先要進行調(diào)查研究，收集有關資料，查明用水情況、廢（污）水的類型、主要污染物及排污去向和排放量，車間、工廠或地區(qū)的排污口數(shù)量及位置，廢（污）水處理情況，是否排入江、河、湖、海，流經(jīng)區(qū)域是否有滲坑等。然后進行綜合分析，確定監(jiān)測項目、采樣點、采樣時間和頻率，選擇采樣方法和監(jiān)測方法，制定程序、措施和實施計劃等。

建設項目在正式投產(chǎn)或使用前和現(xiàn)有污染源治理設施建成投入使用前，建設單位必須向負責項目審批的環(huán)境保護局申請“三同時”竣工驗收監(jiān)測或治理設施的竣工驗收監(jiān)測，監(jiān)測由環(huán)境保護監(jiān)測機構(gòu)負責實施，其監(jiān)測結(jié)果是驗收的依據(jù)。

各級環(huán)境保護局所屬環(huán)境監(jiān)測站可接受環(huán)境污染糾紛當事人的委托進行監(jiān)測，并應及時向環(huán)境保護局報告。糾紛當事人對監(jiān)測數(shù)據(jù)有異議時，可向上一級環(huán)境保護局所屬環(huán)境監(jiān)測站申請進行復核。

生態(tài)環(huán)境主管部門應當加強對排污許可的事中事后監(jiān)管，將排污許可檢查納入生態(tài)環(huán)境年度計劃，根據(jù)排污許可管理類別、排污單位信用記錄和生態(tài)環(huán)境管理需要等因素，合理確定檢查頻次和檢查方式。

生態(tài)環(huán)境主管部門應當在全國排污許可證管理信息平臺上記錄檢查時間、內(nèi)容、結(jié)果以及處罰決定，同時將處罰決定納入國家有關信用信息系統(tǒng)向社會公布。

排污單位應當配合生態(tài)環(huán)境主管部門監(jiān)督檢查，如實反映情況，并按照要求提供排污許可證、環(huán)境管理臺賬記錄、排污許可證執(zhí)行報告、自行監(jiān)測數(shù)據(jù)等相關材料。

生態(tài)環(huán)境主管部門依法通過現(xiàn)場監(jiān)測、排污單位污染物排放自動監(jiān)測設備、全國排污許可證管理信息平臺獲得的排污單位污染物排放數(shù)據(jù)，可以作為判定污染物排放濃度是否超過許可排放濃度的證據(jù)。

排污單位自行監(jiān)測數(shù)據(jù)與生態(tài)環(huán)境主管部門及其所屬監(jiān)測機構(gòu)在行政過程中收集的監(jiān)測數(shù)據(jù)不一致的，以生態(tài)環(huán)境主管部門及其所屬監(jiān)測機構(gòu)收集的監(jiān)測數(shù)據(jù)作為行政依據(jù)。

國家鼓勵排污單位采用污染防治可行技術。生態(tài)環(huán)境主管部門制定并公布污染防治可行技術指南。

排污單位未采用污染防治可行技術的，生態(tài)環(huán)境主管部門應當根據(jù)排污許可證、環(huán)境管理臺賬記錄、排污許可證執(zhí)行報告、自行監(jiān)測數(shù)據(jù)等相關材料，以及生態(tài)環(huán)境主管部門及其所屬監(jiān)測機構(gòu)在行政過程中收集的監(jiān)測數(shù)據(jù)，綜合判斷排污單位采用的污染防治技術能否穩(wěn)定達到排污許可證規(guī)定；對不能穩(wěn)定達到排污許可證規(guī)定的，應當提出整改要求，并可以增加檢查頻次。

制定污染防治可行技術指南，應當征求有關部門、行業(yè)協(xié)會、企業(yè)事業(yè)單位和社會公眾等方面的意見。