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發(fā)布時間:2021-09-22 10:35  

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基因的分子手術(shù)是相當(dāng)復(fù)雜的過程,其中zui重要的是連接酶

互補堿基之間的配對,形成雙鏈。并在DNA連接酶的作用下,使同一DNA分子的兩端連接成環(huán)狀,或使兩個分子連成一大的線狀分子。不同限制性內(nèi)切酶切割DNA產(chǎn)生的三種不同類型的末端。

基因的分子手術(shù)是相當(dāng)復(fù)雜的過程,除了需要限制性內(nèi)切酶外,還需要其他- -些工具酶包括連接酶、DNA 聚合酶、RNA聚合酶、核酸酶、末端修飾酶等,對DNA或RNA進行各種各樣的修飾。其中zui重要的是連接酶。




T4 RNA連接酶

用途:用RNA 3'末端標記;RNA和RNA分子間連接;寡核苷酸的環(huán)化;tRNA修飾;5' RACE中寡核苷酸連接到cDNA單鏈;在蛋白質(zhì)特定位點引入非天然氨基酸。

來源:由大腸桿1菌表達,表達基因的來源為T4嗜菌體。

活性定義:37℃30分鐘內(nèi),催化1 nmol 5'-[P]-(A)12-18成為磷酸酶不能消化的環(huán)形產(chǎn)物所需的酶量定義為1個活性單位。

活性檢測條件:50mM Tris-HCl(pH7.5),10mM MgCl2,10mM DTT,1mM ATP,10μM 5'-[P]-(A)12-18(10μM in 5'-termini)。

純度:不含DNA內(nèi)切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷1酸酯酶。

酶儲存溶液:10mM Tris-HCl(pH7.5),1mM DTT,50mM KCl,0.1mM EDTA,50%(v/v)glycerol。

Reaction Buffer(10X):500mM HEPES-NaOH(pH8.0 at 25℃),100mM MgCl2,100mM DTT。



DNA copy主要的特點是半保留copy、半不連續(xù)copy。在copy過程中,原來雙螺旋的兩條鏈并沒有被破壞,它們分成單獨的鏈,每一條舊鏈作為模板再合成一條新鏈,這樣在新合成的兩個DNA分子中,一條鏈是舊的而另外一條鏈是新的,因此這種copy方式被稱為半保留copy。

DNA的兩條鏈是反向平行的,一條是 5'→3'方向,另一條是 3'→5'方向。在copy起點處,兩條鏈解開形成copy泡(replication bubble ), DNA向兩側(cè)copy形成兩個copy叉(replication fork)。隨著DNA的不斷解旋,兩條鏈變成單鏈形式,可以作為模板合成新的互補鏈。但是,生物細胞內(nèi)所有的DNA聚合酶都只 能催化 5'→3'延伸。因此,以3 '→5'的鏈為模板鏈時,DNA聚合酶可以沿 5'→3'的方向合成互補的新鏈,這條鏈稱為前導(dǎo)鏈(leading strand )。當(dāng)以另一條鏈為模板時則不能連續(xù)合成新鏈,這條鏈稱為滯后鏈(lagging strand )。這時,DNA聚合酶從copy叉的位置開始向遠離copy叉的方向合成1?2 kb的新鏈片段,待copy叉向前移動相應(yīng)的距離后,又重復(fù)這一過程,合成另一個類似大小的新鏈片段,這些片段被稱為岡崎片段(Okazaki fragment)。zui后,由另一種DNA聚合酶和DNA連接酶負責(zé)把這些岡崎片段之間的RNA引物除去,并把缺口補平,使岡崎片段連成完整的DNA鏈。這種前導(dǎo)鏈的連續(xù)copy和滯后鏈的不連續(xù)copy在生物細胞中是普遍存在的,稱為DNA的半不連續(xù)copy。



置換合成法。該方法利用鏈在反轉(zhuǎn)錄酶作用下產(chǎn)生的DNA RNA雜交鏈不用堿變性,而是在dNTP存在下。利用RNA酶H在雜交鏈的mRNA鏈上造成切口和缺口。從而產(chǎn)生一系列RNA引物,使之成為合成第二鏈的引物。在大腸DNA聚合酶工的作用下合成第二鏈。該反應(yīng)有3個主要優(yōu)點:①非常有效;②直接利用鏈反應(yīng)產(chǎn)物,無須進一步處理和純化;③不必使用S1核酸酶來切割雙鏈cDNA中的單鏈發(fā)夾環(huán)。