由于生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥在商品形態(tài)上區(qū)別不大，加之一些廠家的夸大宣傳，給廣大農(nóng)民和一些經(jīng)銷商造成概念上的混淆。其實(shí)，生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥是有本質(zhì)區(qū)別的。

　　一、考量指標(biāo)不同。生物有機(jī)肥以有效活菌數(shù)和有機(jī)質(zhì)為考量指標(biāo)，而精制有機(jī)肥只考量有機(jī)質(zhì)。簡單說，生物有機(jī)肥含菌，精制有機(jī)肥不含菌。

　　第二、管理權(quán)限不同。生物有機(jī)肥的管理、發(fā)證機(jī)關(guān)為國家部，只有獲得農(nóng)部微生物肥料登記證的生物有機(jī)肥才允許生產(chǎn)、銷售和使用；精制有機(jī)肥的管理、發(fā)證機(jī)關(guān)為省級農(nóng)業(yè)主管部門。這是區(qū)別生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥很直接的方法。

　　第三、生產(chǎn)工藝不同。生物有機(jī)肥是在發(fā)酵腐熟的有機(jī)肥中加入有益菌制成的，生產(chǎn)工藝的核心是均種的發(fā)酵培養(yǎng)，培養(yǎng)結(jié)果要使產(chǎn)品中的有效活菌數(shù)達(dá)到農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的要求，即每克2000萬個(gè)以上，否則就是不合格產(chǎn)品。土壤理化性狀的改善，加強(qiáng)了土壤有益微生物的活動(dòng)，從而大限度促使有機(jī)物分解轉(zhuǎn)化，產(chǎn)生多種營養(yǎng)物質(zhì)和刺激性物質(zhì)，反過來又刺激微生物的生長發(fā)育，促進(jìn)作物生長，最終達(dá)到增產(chǎn)增收的目的。而精制有機(jī)肥的生產(chǎn)工藝僅僅是有機(jī)肥的腐熟。

大量元素水溶性肥料（Water Soluble Fertilizer，簡稱WSF)，是一種可以完全溶于水的多元復(fù)合肥料，它能迅速地溶解于水中，更容易被作物吸收，而且其吸收利用率相對較高，更為關(guān)鍵的是它可以應(yīng)用于噴滴灌等設(shè)施農(nóng)業(yè)，實(shí)現(xiàn)水肥一體化，達(dá)到省水省肥省工的效能。大量的硫酸鈣(石膏)用于改良鹽堿地或被海水淹沒過的土壤，有良好的效果。 一般而言，水溶性肥料可以含有作物生長所需要的全部營養(yǎng)元素，如N、P、K、Ca、Mg、S以及微量元素等

有機(jī)肥料含有植物需要的大量營養(yǎng)成分，對植物的養(yǎng)分供給比較平緩持久，有很長的后效。有機(jī)肥料還含有多種微量元素。由于有機(jī)肥料中各種營養(yǎng)元素比較完全，而且這些物質(zhì)完全是沒有毒、無害、無污染的自然物質(zhì)，這就為生產(chǎn)高產(chǎn)、好的、無污染的綠色食品提供了必須條件。有機(jī)肥料含有多種糖類，施用有機(jī)肥增加了土壤中各種糖類。收獲植物及其加工殘物也是一類具有較好應(yīng)用價(jià)值的農(nóng)家肥，其中大豆餅、棉籽餅等餅粕類養(yǎng)分含量比較高，特別是氮都在5%以上。有了糖類，有了有機(jī)物在降解中釋放的大量能量，土壤微生物的生長、發(fā)育、繁殖活動(dòng)就有了能源。