轉錄組測序

轉錄組即某個物種或特定細胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環(huán)境下，其基因表達情況是不相同的。5、滴度檢測:細胞為30%－50％時加入病毒上清液，檢測陽性細胞比例。轉錄組測序（RNA-Seq）是指利用第二代高通量測序技術進行cDNA測序，快速地獲取某一物種特定qi官或組織在某一狀態(tài)下的轉錄本。相對于傳統(tǒng)芯片而言，RNA-Seq無需預先設計探針，即可對物種的細胞類型的轉錄組進行檢測，能夠提供較的數(shù)字化信號，更高的檢測通量以及更廣泛的檢測范圍，是目前深入研究轉錄組復雜性的良好工具。

lncRNA測序

長鏈非編碼RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）一般是指長度大于200 nt的RNA，位于細胞核內或胞漿中，不參與蛋白質編碼功能，以RNA形式在多種層面上（表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等）調控基因的表達水平，在生命活動中具有重要作用。所有樣品4C離心，轉速:13500轉1分鐘，時間:15min。

長鏈非編碼RNA測序（long non-coding RNA sequencing，lncRNA-Seq）是一種使用特定方法降低樣本中rRNA 的豐度，對富集到的 RNA進行文庫構建，再對高通量測序儀產(chǎn)出的數(shù)據(jù)進行信息分析的研究方法。由于線粒體有著與真核生物長期共生的進化歷史，因此其基因組包含了反映物種進化的關鍵信息，同時，相對于核基因組，線粒體基因組小，容易對大量物種進行橫向的比較分析，有利于生物進化的研究，因而受到進化生物學家的鐘愛。lncRNA-Seq可一次性獲得樣本中全部的lncRNAs信息，對lncRNAs的類別、功能進行的深入分析，從而快速準確地獲得與特定生物學過程（例如發(fā)育、疾病等）相關 lncRNA信息。

RNA pull down 檢測

RNA   pull down：RNA沉淀檢測，是檢測RNA結合蛋白與其靶RNA之間相互作用的主要實驗方法之一。使用體外轉錄將RNA進行生物素標記，并與細胞蛋白裂解液孵育，形成RNA-蛋白復合物。外顯子測序外顯子組測序（exome-seq）是對定向富集的基因組DNA進行高通量測序，它能夠以相對低的費用對人類外顯子組進行拷問。復合物通過磁珠結合后分離，復合物純化洗脫后通過Western blot驗證檢測特性的蛋白。若篩選可能結合的蛋白通過質譜實驗進行檢測篩選。