醫(yī)院污水處理過程中排出的污泥按每張病床計，每天平均為0.7~1升，含水95%，含有污水中病原體總量的70~80%，必須進行消毒處理。消毒方法有加熱消毒、化學藥劑消毒、γ射線消毒等。加熱消毒熱源通常為蒸汽、電能或生物能(高溫堆肥)，有的地區(qū)可以用太陽能。或者用焚燒法處理(見污泥焚燒)。化學藥劑消毒可用漂、石灰、氨水、或等。由于醫(yī)院運行初期，下游市政污水處理廠建設不完善，無法接納污水。用漂或時,有效氯用量約為污泥量的2.5%。用堿性藥劑時，污泥的pH值達到12后，保持半小時以上。γ射線消毒可用60鈷或一些裂變產(chǎn)物的混合物作輻射源，輻射劑量為20~30萬倫琴。用此法對污泥消毒不產(chǎn)生臭氣，并可改善污泥的脫水和沉降性，但費用較高。

醫(yī)院污水處理主要是消毒，即殺滅病原體。常用的方法是氯化消毒或用臭氧消毒(見水的消毒、廢水氧化處理法)。

醫(yī)院污水處理不達標一直是危害環(huán)境的重要因素。經(jīng)過有關(guān)部門長期調(diào)查研究顯現(xiàn)醫(yī)院污水處理不徹底主要有下列因素。

1.分類廢水所使用藥劑為了減低成本都是有很強針對性。從而造成各分類廢水處理良好，綜合水還是處理不達標。

2.為水質(zhì)清澈和降低成本使用大量石灰。但是卻產(chǎn)生大量污泥，往往廢水處理成本中30%---40%是處理污泥所產(chǎn)生。

廢水處理工藝特點：加強處理效果的一級強化處理可以提高處理效果，可將攜帶病毒、病菌的顆粒物去除，提高后續(xù)深化消毒效果并降低消毒劑的用量。其中對現(xiàn)有一級處理工藝進行改造可充分利用現(xiàn)有設施，減少投資費用。

廢水處理適用范圍：加強處理效果的一級強化處理適用于處理出水終進入二級處理城市污水處理廠的綜合醫(yī)院。