病因尚無定論，目前主要有神經系統(tǒng)損傷、腦的特定部位功能低下、多巴胺系統(tǒng)缺陷、遺傳、病毒感染和免疫缺陷等10余種觀點和假說。特別需要指出的是，根據(jù)世衛(wèi)組織的介紹，現(xiàn)在并無證據(jù)顯示任何可能增加自閉癥患病風險。此前提示存在因果聯(lián)系的研究被發(fā)現(xiàn)研究方法存在嚴重缺陷。現(xiàn)有醫(yī)學手段還不能從根本上治好自閉癥。專家說，2歲至6歲是自閉癥最為適佳的時機，越早療養(yǎng)效果越好。目前相關療法主要有行動療法、藥物療法、食物療法和心理療法。

適當教育設施漸受重視的同時，以行為學說為基礎之式亦開始發(fā)展，到了一九六Ｏ年代中期，制約理論已經廣泛的被運用在多種兒童問題的療上，而自閉癥兒童經由行為的隔離、消弱、懲罰、差別增強等方法而改善不當?shù)男袨?，包括自傷、自我刺激、過動、攻擊行為等。后來操作制約技巧開始運用在自閉癥患者其它能力的增進，如生活自理、職能訓練等，甚至更進一步被運用在社會人際互動及語言溝通能力之訓練上。

3歲的天天一個人玩的時候總是嘴里唧唧咕咕地說個不停，有時候是對著書本或玩具說。旁人也都聽不清她說什么，也弄不明白她在想些什么。媽媽很擔心，她究竟在跟誰說話？難道是得了自閉癥？其實，這樣的擔心是多余的。自言自語是3歲孩子中很普遍的正?，F(xiàn)象。3歲，正是幼兒語言發(fā)展從外部語言過渡到內部語言的關鍵階段，自言自語其實正是她將外部語言轉為內部語言的一種表現(xiàn)，這其實是她們把內心思考的內容用語言表達了出來。

鑒于音樂療法關注的是人身心兩方面的整體調節(jié)，強調改善癥狀，提高人體自愈能力和生存質量，而不是針對病原體和病灶。因此，音樂治理作為綜合療法的一部分或康復療理方法之一，可廣泛用于臨床各科病人。作為單獨的療方法，音樂療法主要用于功能失調和身心疾病患者如功能性血壓、功能性胃腸病，睡眠障礙，心境障礙（如抑郁焦慮性的障礙）和自閉癥等精神障礙患者的療法。