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發(fā)布時間:2021-09-03 00:26  
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原位雜交試驗
收集斑馬魚的胚胎,在Holfretor水中培養(yǎng),到達所需要的發(fā)育時期時,用蛋白酶去除卵膜,用4%多聚甲醛固定,在4℃保存,二十四小時后用50%甲6醇2%多聚甲醛溶液洗,然后換成甲9醇,在-20C 保存,待用(兩天和兩天以上的胚胎需要用雙氧6水處理,去除色素?;蛘呤褂帽斤畴逑∪芤号囵B(yǎng),可阻斷色素的形成)
原位雜交中探針的選擇
DNA探針、RNA探針和寡核苷酸探針均能通過不同的酶促分子反應進行標記。寡核苷酸探針的長度較短,因此避免了探針內部退火的問題,在雜交時的滲透能力也更好,探針與靶標的接觸這是影響原位雜交是否成功的重要因素之一。DNA探針、RNA探針在合成時需要控制探針片段長度,通常300-1000bp左右,能覆蓋到較長片段的靶核酸序列,增加檢測的靈敏度。
雜交液中的陽離子濃度通過靜電排斥作用影響了雜交體之間的鏈穩(wěn)定性,較高的鹽濃度將增加雜交體的穩(wěn)定性。大于0.4M的Na離子濃度,對Tm值、雙鏈復性速率的影響不大,但隨著Na離子濃度的降低,將顯著影響Tm值和雙鏈復性速率。
有2機溶2劑(甲酰胺)的作用是降低DNA-DNA和DNA-RNA等雙鏈體的解鏈溫度。通常DNA需要在0.1~0.2M Na 90~100℃的條件下變性,那么應用于原位雜交,樣品必須在65~75℃的條件下進行長時間變性,這將導致樣品形態(tài)學的破壞。50%甲酰胺的應用能將雜交溫度降至30~45℃。
硫酸葡聚糖具有很強的水合性,高濃度的硫酸葡聚糖會使得核酸分子無法獲得周邊親水環(huán)境,增加了探針濃度,加快雜交反應速率。