擔憂在于“與糧爭地”，鈴木警告說，大規(guī)模改種生物燃料植物已經造成美國和墨西哥玉米價格上漲，并可能導致發(fā)展中國家糧食短缺。2007年美國25%的玉米收成變成了乙醇燃料，但另一方面，糧農組織2007年底的一份報告說，受大量糧食被轉變?yōu)樯锶剂系纫蛩氐挠绊?，世界正在經歷“前所的未有”的糧食危機。有聯(lián)合國官員認為，使用糧食生產燃料是一項罪行。就算能源作物本身不可食、也可以在不食之地種植，但是還是有減少糧食生產的危險性。

生物能源，特別是生物燃料，因其可以利用廣闊的農產品下腳料作為生產原料，而且可以直接替代車用燃油，因而引起汽車消費大國以及農業(yè)大國的廣泛興趣。巴西、美國、歐盟等，在發(fā)展生物能源領域走在了世界前列，提供了許多有價值的經驗。燃料農業(yè)為轉基因等高科技手段的大面積推廣提供了可能，并且可以為重要性日益凸現(xiàn)的生物燃料提供充足的原料。國際貨幣組織也警告說，全球用于生物燃料的谷物生產不斷增加有可能對世界貧困產生嚴重影響。

磷肥與鉀肥生產過程中所消耗的能源要低許多(主要是在機械開采、粉碎、干燥等環(huán)節(jié))?；试谏镆掖?、生物柴油生產過程所消耗的能源中分別占45%、24%。在生物柴油的生產過程中，需要進行酯交換反應，而這也要占到所消耗能源的35%。我國正在擬訂生物能源替代石油的中長期發(fā)展目標，到2020年，生物燃料生產規(guī)模達到2000萬噸，其中生物乙醇1500萬噸、生物柴油500萬噸。目前，生物燃料主要被用于替代化石燃油作為運輸燃料，如替代燃料乙醇和替代石油基柴油的生物柴油。如果進展順利，到2020年，達到3000萬噸以上。

是將農林廢物作為原材料，經過粉碎、混合、擠壓、烘干等工藝，制成各種成型（如塊狀、顆粒狀等）的，可直接燃燒的一種新型清潔燃料。在這一過程中伴隨著大量植被的繁衍生息為人類的發(fā)展建設提供了可長期利用的能量材料。 而當它們被利用時，構成生物的基本元素 (C、O、H、N 等) 又為新生生物所用，而儲存在其化學鍵中的能量被釋放出來或轉化成其他形式的能量。2007年11月發(fā)布的水資源評價成果顯示，按目前正常需要和不超采地下水，正常年份中國缺水近400億立方米。