認定機構收到的評價意見和中介機構的專項審計報告后，對申請企業(yè)提出認定意見，并確定高新技術企業(yè)認定名單。高新技術企業(yè)是指在《國家重點支持的高新技術領域》內，持續(xù)進行 研究開發(fā)與技術成果轉化，形成企業(yè)核心自主知識產(chǎn)權，并以此為基礎開展經(jīng)營活動，在中國境內(不包括港、澳、臺地區(qū))注冊的居民企業(yè)。高新技術企業(yè)是目前普遍科技類項目之一，不僅大大提升企業(yè)名度，還可以享受幾十萬資金獎補及企業(yè)所得稅減免等多項優(yōu)惠政策。

日常要做好研發(fā)項目檔案管理，包括研發(fā)項目立項報告、中期檢查報告紀要、結題報告、測試報告等。高企認定申報時候上傳相關文檔作為附件證明項目真實性、先進性和管理規(guī)范性的證明。企業(yè)從事研發(fā)和相關技術創(chuàng)新活動的科技人員占企業(yè)當年職工總數(shù)的比例不低于10%，其中大專以上學歷的科技人員占全部科技人員人數(shù)的30%以上。如果企業(yè)在同一年度通過培育入庫和出庫的，還可同時享受入庫獎補和出庫獎補。

 不具備知識產(chǎn)權的企業(yè)不能認定為高新技術企業(yè)。高新技術產(chǎn)品(服務)是指對其發(fā)揮核心支持作用的技術屬于《國家重點支持的高新技術領域》規(guī)定范圍的產(chǎn)品(服務)。很多科技項目都需要在具備高新技術企業(yè)資質的基礎上申報。如中小企業(yè)科技扶持資金等項目類；如工程技術研究中心等認定類。通過高企認定，要求企業(yè)按照現(xiàn)代企業(yè)制度進行管理和經(jīng)營，引導企業(yè)自覺用高企的理念管理企業(yè)。

在高新技術企業(yè)認定過程中所指的企業(yè)總收入也是有一定界定的，指的是企業(yè)的收入總額減去不征稅的收入，具體按照國家相關法律法規(guī)的規(guī)定計算。高企認定是科技型企業(yè)的“創(chuàng)新體系認證”，企業(yè)做高企認定可以享有稅收減免、資金獎勵以及提升品牌吸引人才等很多好處，因此很多企業(yè)都想要做高新技術企業(yè)認定。稅務部門會對企業(yè)申報的銷售收入和申報所得稅銷售收入進行核查比對，如果企業(yè)申報的這兩類收入之間有差異的話須在其他證明材料中提供書面說明。