擴增檢測實驗室原則上分為4個單獨的工作區(qū)域：試劑儲存和準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增反應混合物配制和擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染，進入各個工作區(qū)域必須嚴格遵循單一方向進行。

 雖然這些污染對PCR實驗結果的影響已經(jīng)受到了廣泛重視，多數(shù)實驗室對污染控制都采取了各種辦法，比如定期大掃除清理、劃分操作區(qū)域、試劑分裝、操作謹慎、重復實驗、多角度驗證結果。但是微量的核酸片段就能被擴增，所以對污染物的控制不僅僅是做到這些就能夠杜絕和避免的，關鍵是需要從源頭控制。

對于一些不常用的試劑，管理人員要定時檢查，以保證試劑包裝完好、標簽完整、字跡清楚。固體試劑應無吸濕、潮解現(xiàn)象;液體試劑應無沉淀物，否則，就應檢查試劑的密封情況。某些試劑要進行特別認真的檢查，如鉀、鈉表面的油封，白磷、表面的水封是否符合要求，以免發(fā)生危險?；瘜W試劑的質(zhì)量是直接影響實驗質(zhì)量的因素之一，管理人員應有一定的試劑質(zhì)量判斷知識。

近年來，食品安全及品質(zhì)問題越來越受到人們的關注。這里說的食品是廣泛意義上的食品，包括初級農(nóng)產(chǎn)品，如：糧谷、油料籽、蔬菜、水產(chǎn)品、畜禽產(chǎn)品、水果等，也包括加工后的食品，如：罐頭、火腿腸、食用油、方便面、醬菜、調(diào)味品等。開展食品檢測的實驗室也越來越多。在這些實驗室中由于性質(zhì)不同，檢測的項目不同，而對實驗室籌建和發(fā)展過程中對儀器的購置和選型有著不同的要求。

還有一個缺點，就是中心實驗室的時效性相對來說差一些。醫(yī)院是收到樣本當天出結果，中心實驗室由于有樣本運輸?shù)臅r間需要兩到三天出報告。但是對于生物標志物來說，由于檢測平臺的復雜度以及臨床普及率，中心實驗室的生物標志物的時效性能夠滿足臨床和研究的要求。