由于生物有機肥和精制有機肥在商品形態(tài)上區(qū)別不大，加之一些廠家的夸大宣傳，給廣大農民和一些經銷商造成概念上的混淆。其實，生物有機肥和精制有機肥是有本質區(qū)別的。

　　一、考量指標不同。生物有機肥以有效活菌數(shù)和有機質為考量指標，而精制有機肥只考量有機質。簡單說，生物有機肥含菌，精制有機肥不含菌。

　　第二、管理權限不同。生物有機肥的管理、發(fā)證機關為國家部，只有獲得農部微生物肥料登記證的生物有機肥才允許生產、銷售和使用；精制有機肥的管理、發(fā)證機關為省級農業(yè)主管部門。這是區(qū)別生物有機肥和精制有機肥很直接的方法。

　　第三、生產工藝不同。生物有機肥是在發(fā)酵腐熟的有機肥中加入有益菌制成的，生產工藝的核心是均種的發(fā)酵培養(yǎng)，培養(yǎng)結果要使產品中的有效活菌數(shù)達到農業(yè)行業(yè)標準的要求，即每克2000萬個以上，否則就是不合格產品。而精制有機肥的生產工藝僅僅是有機肥的腐熟。氮素化肥、過磷酸鈣嚴禁與堿性物質（石灰、草木灰等）混合堆放，以防氮素化肥揮發(fā)損失和降低磷肥的肥效。

含硫肥料主要用于調整土壤的堿性和鹽性（土壤含過多的氯化鈉和碳酸鹽）。大量的硫酸鈣(石膏)用于改良鹽堿地或被海水淹沒過的土壤，有良好的效果。印度成功地用硫鐵礦改良堿性土壤或石灰質土壤。對于一些pH較高的缺鎂土壤，不宜施用白云石粉，可施用硫酸鎂或無水鉀鎂礬，也可以使用蛇紋石類硅酸粉。近年來，發(fā)展了一種新的技術，把熔融的元素硫涂包在尿素顆粒表面，一方面向土壤提供硫元素，另一方面使尿素成為緩效氮肥以提高氮素的利用率。微生物在繁殖中能產生大量的植物生長素，刺激和調節(jié)作物生長，使植株生長健壯，促進對營養(yǎng)元素的吸收。

有機肥料的作用有以下兩方面：(1）改良土壤，培肥地力。有機肥料中的主要物質是有機質，施用有機肥料增加了土壤中有機質的含量。有機質可以改善土壤物理、化學和生物特性，熟化土壤，培肥地力。（2）增加作物產量和提高農產品品質，氨基酸等物質，不氮、磷、鉀等養(yǎng)分外，還含有多種糖類，氨基酸等物質，不僅可為作物提供營養(yǎng)，而且可以促進土壤微生物的活動。有機肥料還含有多種微量元素，如畜禽糞便每100千克中含硼2.2～2.4克，鋅2.9～29.0克，錳14.3～26.1克，鉬0.3～0.4克，有效鐵2.9～29.0克。生物有機復合肥是汲取傳統(tǒng)有機肥料之精華，結合現(xiàn)代生物技術，加工而成的高科技產品。有機肥和化肥配合施用增產效果顯著，而且能改善產品的品質，使蔬菜中肖酸鹽、亞肖酸鹽含量降低，維生素C含量提高，增加瓜果中的含糖量。

廄肥的作用：①提供植物養(yǎng)分。包括必需的大量元素氮、磷、鉀、鈣、鎂、硫和微量元素鐵、錳、硼、鋅、鉬、銅等無機養(yǎng)分；氨基酸、酰胺、核酸等有機養(yǎng)分和活性物質如維生素B1、B6等。保持養(yǎng)分的相對平衡。②提高土壤養(yǎng)分的有效性。廄肥中含大量微生物及各種酶（蛋白酶、脲酶、磷酸化酶），促使有機態(tài)氮、磷變?yōu)闊o機態(tài)，供作物吸收。并能使土壤中鈣、鎂、鐵、鋁等形成穩(wěn)定絡合物，減少對磷的固定，提高有效磷含量。③改良土壤結構。腐殖質膠體促進土壤團粒結構形成，降低容重，提高土壤的通透性，協(xié)調水、氣矛盾。還能提高土壤的緩沖性和改良礦毒田。④培肥地力，提高土壤的保肥、保水力。廄肥腐熟后主要作基肥用?？傮w來說，生物肥料（微生物肥料）的作用為以下幾點：1．增進土壤肥力施用固氮微生物肥料，可以增加土壤中的氮素來源。新鮮廄肥的養(yǎng)分多為有機態(tài)，碳氮比（C/N）值大，不宜直接施用，尤其不能直接施入水稻田。